基因探針,即核酸探針,是一段帶有檢測(cè)標(biāo)記,且順序已知的,與目的基因互補(bǔ)的核酸序列(DNA或RNA)?;蛱结樛ㄟ^(guò)分子雜交與目的基因結(jié)合,產(chǎn)生雜交信號(hào),能從浩瀚的基因組中把目的基因顯示出來(lái)。根據(jù)雜交原理,作為探針的核酸序列至少必須具備以下兩個(gè)條件:①應(yīng)是單鏈,若為雙鏈,必須先行變性處理。②應(yīng)帶有容易被檢測(cè)的標(biāo)記。它可以包括整個(gè)基因,也可以僅僅是基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之轉(zhuǎn)錄而來(lái)的RNA。
寡核苷酸探針的來(lái)源是什么?
DNA探針根據(jù)其來(lái)源有3種:一種來(lái)自基因組中有關(guān)的基因本身,稱為基因組探針;另一種是從相應(yīng)的基因轉(zhuǎn)錄獲得了mRNA,再通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄得到的探針,稱為cDNA探針。與基因組探針不同的是,cDNA探針不含有內(nèi)含子序列。此外,還可在體外人工合成堿基數(shù)不多的與基因序列互補(bǔ)的DNA片段,稱為寡核苷酸探針。
寡核苷酸探針是怎么制備的?
進(jìn)行分子突變需要大量的探針拷貝,后者一般是通過(guò)分子克隆獲得的??寺∈侵赣脽o(wú)性繁殖方法獲得同一個(gè)體、細(xì)胞或分子的大量復(fù)制品。當(dāng)制備基因組DNA探針前,應(yīng)先制備基因組文庫(kù),即把基因組DNA打斷,或用限制性酶作不完全水解,得到許多大小不等的隨機(jī)片段,將這些片段體外重組到運(yùn)載體(噬菌體、質(zhì)粒等)中去,再將后者轉(zhuǎn)染適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞如大腸肝菌,這時(shí)在固體培養(yǎng)基上可以得到許多攜帶有不同DNA片段的克隆噬菌斑,通過(guò)原位雜交,從中可篩出含有目的基因片段的克隆,然后通過(guò)細(xì)胞擴(kuò)增,制備出大量的探針。
為了制備cDNA探針,首先需分離純化相應(yīng)mRNA,這從含有大量mRNA的組織、細(xì)胞中比較容易做到,如從造血細(xì)胞中制備α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,就可以合成與之互補(bǔ)的DNA(即cDNA),cDNA與待測(cè)基因的編碼區(qū)有完全相同的堿基順序,但內(nèi)含子已在加工過(guò)程中切除。寡核苷酸探針是人工合成的,與已知基因DNA互補(bǔ)的,長(zhǎng)度可從十幾到幾十個(gè)核苷酸的片段。如僅知蛋白質(zhì)的氨基酸順序量,也可以按氨基酸的密碼推導(dǎo)出核苷酸序列,并用化學(xué)方法合成。
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